隨著畜牧業向集約化、現代化的方向發展，養殖場（戶）的觀念也逐步發生改變。從原來“治重于防”的想法轉變到“防重于治”的認識，重點圍繞“預防為主”的原則，因此，消毒藥物也就得到越來越廣泛的使用，如何選擇便宜、高效、安全的消毒藥？

堿類消毒藥

包括氫氧化鈉（燒堿）、生石灰及草木灰，它們都是直接或間接以堿性物質對病原微生物進行殺滅作用。消毒原理是：水解病原菌的蛋白質和核酸，破壞細菌的正常代謝，最終達到殺滅細菌的效果。

氫氧化鈉對紡織品及金屬制品有腐蝕性，故不宜對以上物品進行消毒，而且對于其它設備、用具在用燒堿消毒半天后，要用清水進行清洗，以免燒傷畜禽的蹄部或皮膚。

新鮮的草木灰含有氫氧化鉀，通常在雨水淋濕之后，能夠滲透到地面。常用對畜禽場地的消毒，特別是對野外放養場地的消毒，這種方法，既可以做到清潔場地，又能有效地殺滅病原菌。

生石灰溶于水之后變成氫氧化鈣，同時又產生熱量。通常配成10%~20%的溶液對畜禽飼養場的地板或墻壁進行消毒，另外生石灰也用于對病死畜禽無害化處理，其方法是在掩埋病死畜禽時先撒上生石灰粉，再蓋上泥土，能夠有效地殺死病原微生物。

強氧化劑型的消毒藥

常用的有：過氧乙酸及高錳酸鉀，它們對細菌、芽胞和真菌有強烈的殺滅作用。

過氧乙酸，消毒時可配成0.2%~0.5%的濃度。對畜禽欄舍、飼料槽、用具、車輛、食品車間地面及墻壁進行噴霧消毒，也可以帶畜禽消毒，但要注意現配現用，因為容易氧化。

高錳酸鉀，是一種強氧化劑，遇到有機物即起氧化作用。因此，不僅可以消毒，又可以除臭，低濃度時還有收斂作用，畜禽飲用常配成0.1%的水溶液，治療胃腸道疾病；0.5%的溶液可以消毒皮膚、粘膜和創傷，用于洗胃和使毒物氧化而分解，高濃度時對組織有刺激和腐蝕性；4%的溶液通常用來消毒飼料槽及用具，效果顯著。

新潔爾滅

新潔爾滅是一種陽離子表面活性劑型的消毒藥，既有清潔作用，又有抗菌消毒效果。它的特點是對畜禽組織無刺激性，作用快、毒性小，對金屬及橡膠均無腐蝕性，但價格較高。0.1%溶液用于器械用具的消毒，0.5%~1%溶液用于手術的局部消毒。但要避免與陰離子活性劑，如肥皂等共用，否則會降低消毒的效果。

有機氯消毒劑

包括消特靈、菌素凈及漂白粉等。它們能夠殺滅細菌、芽胞、病毒及真菌，殺菌作用強，但藥效持續時間不長。主要用于畜禽欄舍、欄槽及車輛等的消毒。另外，漂白粉還用于對飲水的消毒，但氯制劑有對金屬有腐蝕性、久貯失效等缺點。

復合酚

又名消毒靈、農樂等，可以殺滅細菌、病毒和霉菌，對多種寄生蟲卵也有殺滅效果。主要用于畜禽欄舍、設備器械、場地的消毒，殺菌作用強，通常施藥一次后，藥效可維持5~7天。但注意不能與堿性藥物或其它消毒藥混合使用。

雙鏈季胺酸鹽類消毒藥

如百毒殺，它是一種新型的消毒藥，具有性質比較穩定，安全性好，無刺激性和腐蝕性等特點。能夠迅速殺滅病毒、細菌、霉菌、真菌及藻類致病微生物，藥效持續時間約為10天左右，適合于飼養場地、欄舍、用具、飲水器、車輛、孵化機及種蛋的消毒，另外也可用于對存有活畜、禽場地的消毒。