良種奶牛的選配，就是有目的地安排公母牛的交配組合。以期后代將雙親優良性狀結合在一起，培育出優秀種牛。選配是培育優秀奶牛后代的良好前提條件。奶牛選配應該主重考慮種公牛本身的品質條件；（如體質外貌、生長發育、產奶性能等）年齡、血統和后裔等多個因素，為種牛選擇最適當的配偶，才能獲得更理想的后代。為了制訂好選配計劃和做好選配工作，應該安以下原則去做；
1、有明確的目標。根據育種目標，對奶牛的群體及個體進行生產性能和外貌調查，為鞏固優良特性、改進不良性狀而進行選配。
2、可根據牛個體親和力和種群的配合力進行選配。在對過去交配結果具體分析的基礎上，從中找出過去那些產生過好的后代選配組合，不但應該繼續維持，而且還應增選具有相應品質的母牛與之交配。
3、選配已定的公牛生產性能與外貌等級應高于與配母牛等級。因公牛有帶動和改進整個牛群的作用，而且選留數量較少，所以對其等級和質量，都應高于母牛。
4、搞好品質選配，一般情況下，優秀的公母牛采用同質選配，品質較差的母牛，在特殊的育種目的下，才采用異質選配。對改良到一定程度的牛群，不能任意用本地的公牛或低代雜種公牛來配種，這樣會使改良效果退化。另外，選配時，一定要避免相同缺陷公母牛交配組合，以免加快缺點的發展。
5、控制近交，近交只宜控制在育種群必要時使用。在一般的繁殖群，遠交則是一種普遍而又長期使用的方法。因此，同一公牛在一個牛群中的使用年限不能過長，應定期做好血統更新工作。一般牛群的近交系數應控制在6.25％以下為宜。
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